Жогорку жана төмөнкү тобокелдиктеги панкреатик аденокарцинома менен ооругандарды аныктоо үчүн жаңы иммундук LncRNA-негизделген колду түзүү |BMC Гастроэнтерология

Уйку безинин рагы дүйнөдөгү эң коркунучтуу шишиктердин бири, прогнозу начар.Ошондуктан, так болжолдоо модели уйку безинин рагынын жогорку коркунучу бар бейтаптарды аныктоо үчүн, дарылоону ылайыкташтыруу жана бул бейтаптардын прогнозун жакшыртуу үчүн зарыл.
Биз UCSC Xena маалымат базасынан Рак Геном Атласы (TCGA) панкреатик аденокарциномасынын (PAAD) RNAseq маалыматтарын алдык, корреляциялык анализ аркылуу иммундук-байланыштуу lncRNAларды (irlncRNAs) аныктап, TCGA менен кадимки панкреатик аденокарцинома ткандарынын ортосундагы айырмачылыктарды аныктадык.DEirlncRNA) TCGA жана уйку безинин кыртышынын генотипинин кыртыш экспрессиясынан (GTEx).Прогностикалык кол тамга моделдерин куруу үчүн андан аркы универсалдуу жана лассо регрессиялык анализдер аткарылды.Андан кийин биз ийри сызыктын астындагы аянтты эсептеп чыктык жана жогорку жана аз коркунучтуу панкреатик аденокарцинома менен ооругандарды аныктоо үчүн оптималдуу кесүү маанисин аныктадык.Клиникалык мүнөздөмөлөрдү, иммундук клетканын инфильтрациясын, иммуносупрессивдүү микрочөйрөнү жана химиотерапияга туруктуулукту салыштыруу үчүн.
Биз 20 DEirlncRNA жуптарын аныктап, бейтаптарды оптималдуу кесүү маанисине ылайык топтодук.Биз прогностикалык кол модели PAAD менен ооруган бейтаптардын прогнозду алдын ала олуттуу көрсөткүчтөрү бар экенин көрсөттү.ROC ийри сызыгынын AUC көрсөткүчү 1 жылдык божомол үчүн 0,905, 2 жылдык болжолдоо үчүн 0,942 жана 3 жылдык болжолдоо үчүн 0,966.Жогорку тобокелдик менен ооруган бейтаптардын жашоо көрсөткүчтөрү төмөн жана начар клиникалык мүнөздөмөлөрү болгон.Биз ошондой эле жогорку тобокелдикке кабылган бейтаптар иммуносупрессияланган жана иммунотерапияга каршылык көрсөтүшү мүмкүн экенин көрсөттүк.Эсептөөчү болжолдоо куралдарынын негизинде паклитаксел, сорафениб жана эрлотиниб сыяктуу ракка каршы дарыларды баалоо PAAD менен ооруган жогорку тобокелдиктеги бейтаптар үчүн ылайыктуу болушу мүмкүн.
Жалпысынан алганда, биздин изилдөө уйку безинин рагы менен ооруган бейтаптарда келечектүү прогностикалык маанини көрсөткөн жупташкан irlncRNAга негизделген жаңы прогностикалык тобокелдик моделин түздү.Биздин прогноздук тобокелдик модели медициналык дарылоо үчүн ылайыктуу PAAD менен ооругандарды айырмалоого жардам берет.
Уйку безинин рагы – беш жылдык жашоо деңгээли төмөн жана жогорку класстагы залалдуу шишик.Диагноз коюлган учурда бейтаптардын көбү өнүккөн стадиясында.COVID-19 эпидемиясынын контекстинде уйку безинин рагы менен ооруган бейтаптарды дарылоодо дарыгерлер жана медайымдар чоң кысымга дуушар болушат, ал эми бейтаптардын үй-бүлөлөрү да дарылоо чечимин кабыл алууда бир нече кысымдарга туш болушат [1, 2].Неоадъюванттык терапия, хирургиялык резекция, нурлануу терапиясы, химиотерапия, максаттуу молекулярдык терапия жана иммундук текшерүү пунктунун ингибиторлору (ICIs) сыяктуу DOADды дарылоодо чоң жетишкендиктерге ээ болгону менен, диагноз коюлгандан кийин 9% гана бейтаптардын 9%ы гана жашайт. ].], 4].Уйку безинин аденокарциномасынын алгачкы белгилери атиптик болгондуктан, бейтаптарга метастаздар көбүнчө өнүккөн стадиясында аныкталат [5].Ошондуктан, ар бир бейтап үчүн жекелештирилген комплекстүү дарылоо жашоону узартуу үчүн гана эмес, жашоо сапатын жакшыртуу үчүн бардык дарылоо варианттарынын артыкчылыктары менен кемчиликтерин таразалоого тийиш [6].Демек, пациенттин прогнозуна так баа берүү үчүн эффективдүү болжолдоо модели зарыл [7].Ошентип, тиешелүү дарылоо PAAD менен ооруган бейтаптардын жашоо жана жашоо сапатын баланс үчүн тандалып алынышы мүмкүн.
PAAD начар прогноз, негизинен, химиотерапия дары каршылык менен шартталган.Акыркы жылдары иммундук текшерүү пунктунун ингибиторлору катуу шишиктерди дарылоодо кеңири колдонулууда [8].Бирок, уйку безинин рагы ICIs колдонуу сейрек ийгиликтүү [9].Ошондуктан, ICI терапиясынан пайда ала турган бейтаптарды аныктоо маанилүү.
Узун коддолбогон РНК (lncRNA) – транскрипттери >200 нуклеотид менен коддолбогон РНКнын бир түрү.LncRNAs кеңири таралган жана адамдын транскриптомунун 80%ке жакынын түзөт [10].Көптөгөн иш lncRNA негизиндеги прогностикалык моделдер пациенттин прогнозун натыйжалуу алдын ала алаарын көрсөттү [11, 12].Мисалы, 18 аутофагия менен байланышкан lncRNAs эмчек рагы [13] боюнча алдын ала кол түзүү үчүн аныкталган.Глиоманын прогностикалык өзгөчөлүктөрүн аныктоо үчүн башка алты иммундук lncRNAs колдонулган [14].
Уйку безинин рак оорусунда, кээ бир изилдөөлөр пациенттин прогнозун алдын ала айтуу үчүн lncRNA негизиндеги кол тамгаларды түзүшкөн.ROC ийри сызыгынын астындагы аянты (AUC) болгону 0,742 жана жалпы жашоо (OS) 3 жыл [15] болгон панкреатикалык аденокарциномада 3-lncRNA кол коюлган.Мындан тышкары, lncRNA экспрессия баалуулуктары ар кандай геномдор, ар кандай маалымат форматтары жана ар кандай бейтаптар арасында өзгөрүп турат жана болжолдуу моделдин иштеши туруксуз.Ошондуктан, биз жаңы моделдөө алгоритмин, жупташтыруу жана итерацияны колдонуп, иммунитетке байланыштуу lncRNA (irlncRNA) кол тамгаларын так жана туруктуу болжолдоочу моделди түзүү үчүн колдонобуз [8].
Нормалдаштырылган RNAseq маалыматтары (FPKM) жана клиникалык уйку безинин рагы TCGA жана генотип кыртышынын экспрессиясы (GTEx) маалыматтары UCSC XENA маалымат базасынан алынган ( https://xenabrowser.net/datapages/ ).GTF файлдары Ensembl маалымат базасынан алынган ( http://asia.ensembl.org ) жана RNAseqтен lncRNA экспрессия профилдерин алуу үчүн колдонулган.Биз ImmPort маалымат базасынан (http://www.immport.org) иммунитетке байланыштуу гендерди жүктөп алдык жана корреляциялык анализди колдонуу менен иммунитетке байланыштуу lncRNAларды (irlncRNAs) аныктадык (p <0.001, r> 0.4).TCGA-PAAD когортундагы (|logFC| > 1 жана GEPIA2 маалымат базасынан (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) алынган irlncRNAs жана дифференциалдуу экспрессияланган lncRNAs кайчылаш аркылуу дифференциалдуу экспрессияланган irlncRNAs (DEirlncRNAs) аныктоо. ) <0,05).
Бул ыкма мурда кабарланган [8].Тактап айтканда, биз жупташкан lncRNA A жана lncRNA B алмаштыруу үчүн X түзөбүз. lncRNA Aнын туюнтма мааниси lncRNA B экспрессия маанисинен жогору болгондо, X 1 деп аныкталат, антпесе X 0 деп аныкталат. Ошондуктан, биз ала алабыз. 0 же – 1 матрицасы. Матрицанын вертикалдык огу ар бир үлгүнү, ал эми горизонталдык огу 0 же 1 мааниси менен ар бир DEirlncRNA жупту билдирет.
Прогностикалык DEirlncRNA жуптарын скрининг үчүн Лассо регрессиясынан кийин бир өзгөрмөлүү регрессия анализи колдонулган.Лассо регрессиялык талдоо 1000 жолу кайталанган кайчылаш текшерүүнү колдонгон (p <0,05), бир чуркоодо 1000 кокус стимулдар.Ар бир DEirlncRNA түгөйүнүн жыштыгы 1000 циклде 100 эседен ашканда, DEirlncRNA жуптары прогностикалык тобокел моделин куруу үчүн тандалган.Андан кийин биз PAAD бейтаптарын жогорку жана төмөнкү тобокелдик топторуна классификациялоо үчүн оптималдуу кесүү маанисин табуу үчүн AUC ийри сызыгын колдондук.Ар бир моделдин AUC мааниси да эсептелген жана ийри сызык катары түзүлгөн.Эгерде ийри сызык максималдуу AUC маанисин көрсөткөн эң жогорку чекитке жетсе, эсептөө процесси токтойт жана модель эң мыкты талапкер болуп эсептелет.1, 3 жана 5 жылдык ROC ийри моделдери курулган.Унивариаттуу жана көп өзгөрмөлүү регрессиялык анализдер прогностикалык тобокелдик моделинин көз карандысыз болжолдуу көрсөткүчтөрүн текшерүү үчүн колдонулган.
XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS жана CIBERSORT сыяктуу иммундук клеткалардын инфильтрациялык ылдамдыгын изилдөө үчүн жети куралды колдонуңуз.Иммундук клетканын инфильтрациясынын маалыматтары TIMER2 маалымат базасынан (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3) жүктөлүп алынган.Курулган моделдин жогорку жана төмөнкү тобокелдик топторунун ортосундагы иммундук инфильтрациялоочу клеткалардын мазмунунун айырмасы Wilcoxon кол коюлган рангдагы тесттин жардамы менен талданды, натыйжалар квадраттык графикте көрсөтүлгөн.Спирман корреляциялык анализи тобокелдик баллынын баалуулуктары менен иммундук инфильтрациялоочу клеткалардын ортосундагы байланышты талдоо үчүн жасалган.Натыйжадагы корреляция коэффициенти ллипоп түрүндө көрсөтүлөт.Маанилүүлүк чеги p <0,05 белгиленген.Процедура R пакети ggplot2 аркылуу аткарылган.Иммундук клетканын инфильтрациясынын ылдамдыгы менен байланышкан моделдин жана ген экспрессиясынын деңгээлдеринин ортосундагы мамилени изилдөө үчүн биз ggstatsplot пакетин жана скрипка сюжетинин визуализациясын аткардык.
Уйку безинин рагы үчүн клиникалык дарылоо моделдерин баалоо үчүн, биз TCGA-PAAD когортунда кеңири колдонулган химиотерапиялык дарылардын IC50 деңгээлин эсептедик.жогорку жана төмөнкү тобокелдик топтордун ортосундагы жарым ингибитор концентрациясынын (IC50) айырмачылыктар Wilcoxon кол коюлган даражадагы сыноону колдонуу менен салыштырылган, жана натыйжалары R. pRRophetic жана ggplot2 колдонуу менен түзүлгөн boxplots катары көрсөтүлгөн. Бардык ыкмалар тиешелүү көрсөтмөлөргө жана нормаларга ылайык келет.
Биздин изилдөөбүздүн иш процесси 1-сүрөттө көрсөтүлгөн. lncRNAs жана иммунитетке байланыштуу гендер ортосундагы корреляциялык анализди колдонуу менен, биз p <0,01 жана r> 0,4 ​​болгон 724 irlncRNA тандап алдык.Биз андан ары GEPIA2нин дифференциалдуу туюндурулган lncRNAларын анализдедик (сүрөт 2A).Жалпысынан 223 irlncRNAs панкреатикалык аденокарцинома менен нормалдуу уйку безинин кыртышынын (|logFC| > 1, FDR < 0,05) ортосунда DEirlncRNAs деп аталган дифференциалдуу түрдө чагылдырылган.
Тобокелдиктин болжолдуу моделдерин куруу.(A) Дифференциалдуу түрдө чагылдырылган lncRNAлардын вулкан сюжети.(B) 20 DEirlncRNA жуптары үчүн лассо коэффициенттеринин бөлүштүрүлүшү.(C) LASSO коэффициентинин бөлүштүрүлүшүнүн жарым-жартылай ыктымалдык дисперсиясы.(D) 20 DEirlncRNA жуптун бир өзгөрмөлүү регрессиялык анализин көрсөткөн токой участогу.
Андан кийин 223 DEirlncRNAны жупташтыруу менен 0 же 1 матрицасын курдук.Жалпысынан 13687 DEirlncRNA жуптары аныкталган.Univariate жана lasso регрессиялык талдоодон кийин, 20 DEirlncRNA жуптары акыры прогноздук тобокелдик моделин куруу үчүн сыналган (Figure 2B-D).Lasso жана бир нече регрессиялык анализдин жыйынтыктарынын негизинде, биз TCGA-PAAD когортундагы ар бир бейтап үчүн тобокелдик упайын эсептедик (таблица 1).Лассо регрессиялык анализинин натыйжаларынын негизинде биз TCGA-PAAD когортундагы ар бир пациент үчүн тобокелдик упайын эсептеп чыктык.ROC ийри сызыгынын AUC көрсөткүчү 1 жылдык тобокелдик моделинин болжолу үчүн 0,905, 2 жылдык болжолдоо үчүн 0,942 жана 3 жылдык болжолдоо үчүн 0,966 болгон (3A-B-сүрөт).Биз 3.105 оптималдуу кесүү маанисин койдук, TCGA-PAAD когортасынын бейтаптарын жогорку жана төмөнкү тобокелдик топторуна стратификацияладык жана ар бир пациент үчүн аман калуу натыйжаларын жана тобокелдик упайларынын бөлүштүрүлүшүн түздүк (Figure 3C-E).Каплан-Мейер талдоо жогорку тобокелдик тобунда PAAD бейтаптардын жашоо төмөн тобокелдик тобуна (б <0.001) (сүрөт 3F) караганда бир кыйла төмөн экенин көрсөттү.
Прогностикалык тобокелдик моделдеринин жарактуулугу.(A) болжолдуу тобокелдик моделинин ROC.(B) 1-, 2- жана 3-жыл ROC прогноздук тобокелдик моделдери.(C) болжолдуу тобокелдик моделинин ROC.Оптималдуу кесүү чекитин көрсөтөт.(DE) Жашоо статусун бөлүштүрүү (D) жана тобокелдик упайлары (E).(F) Каплан-Мейер жогорку жана төмөн тобокелдик топторундагы PAAD бейтаптарды талдоо.
Биз андан ары клиникалык мүнөздөмөлөр боюнча тобокелдик упайларындагы айырмачылыктарды бааладык.Стоп графиги (Figure 4A) клиникалык мүнөздөмөлөр менен тобокелдик упайларынын ортосундагы жалпы байланышты көрсөтөт.Атап айтканда, улгайган бейтаптар тобокелдик упайлары жогору болгон (Figure 4B).Кошумчалай кетсек, II стадиядагы бейтаптар I стадиядагы бейтаптарга караганда тобокелдиктин упайлары жогору болгон (Figure 4C).PAAD бейтаптарындагы шишик даражасына карата 3-даражадагы бейтаптар 1 жана 2-класстагы бейтаптарга караганда жогору тобокелдик упайларына ээ болушкан (Figure 4D).Биз андан ары Univariate жана көп өзгөрмөлүү регрессия талдоо жүргүзгөн жана тобокелдик упай (б <0.001) жана жашы (б = 0.045) PAAD (Figure 5A-B) менен ооруган көз карандысыз прогностикалык факторлор экенин көрсөттү.ROC ийри сызыгы тобокелдик баллы PAAD менен ооруган бейтаптардын 1-, 2- жана 3 жылдык жашоосун болжолдоодо башка клиникалык мүнөздөмөлөргө караганда жогору экенин көрсөттү (Figure 5C-E).
Прогностикалык тобокелдик моделдеринин клиникалык мүнөздөмөлөрү.Гистограмма (A) (B) жашын, (C) шишик стадиясын, (D) шишик даражасын, тобокелдик упайын жана TCGA-PAAD когортундагы бейтаптардын жынысын көрсөтөт.**p <0,01
Прогностикалык тобокелдик моделдерин көз карандысыз болжолдоочу талдоо.(AB) Прогноздук тобокелдик моделдеринин жана клиникалык мүнөздөмөлөрүнүн Univariate (A) жана Multivariate (B) регрессиялык анализдери.(CE) 1-, 2- жана 3-жыл ROC прогноздук тобокелдик моделдери жана клиникалык мүнөздөмөлөрү үчүн
Ошондуктан, биз убакыт жана тобокелдик упайларынын ортосундагы байланышты карап чыктык.Биз PAAD бейтаптарындагы тобокелдик упайынын CD8+ Т-клеткалары жана NK клеткалары (Figure 6A) менен тескери байланышта экенин, бул жогорку тобокелдик тобунда басылган иммундук функцияны көрсөткөн.Биз ошондой эле жогорку жана төмөн тобокелдик топторунун ортосундагы иммундук клетка инфильтрациясынын айырмасын бааладык жана ошол эле натыйжаларды таптык (сүрөт 7).Жогорку тобокелдик тобунда CD8+ Т-клеткаларынын жана NK клеткаларынын инфильтрациясы азыраак болгон.Акыркы жылдары, иммундук текшерүү пунктунун ингибиторлору (ICIs) катуу шишиктерди дарылоодо кеңири колдонулат.Бирок, уйку безинин рагына ICI колдонуу сейрек ийгиликтүү болгон.Ошондуктан, биз жогорку жана төмөн тобокелдик топторунда иммундук текшерүү гендердин экспрессиясын баалады.Биз CTLA-4 жана CD161 (KLRB1) тобокелдиктин төмөн тобунда (Figure 6B-G) ашыкча экспрессияланганын байкадык, бул тобокелдиктин төмөн тобунда PAAD бейтаптары ICIге сезгич болушу мүмкүн экенин көрсөтүп турат.
Прогностикалык тобокелдик моделинин жана иммундук клетканын инфильтрациясынын корреляциялык анализи.(A) Прогноздук тобокелдик модели менен иммундук клетканын инфильтрациясынын ортосундагы корреляция.(BG) жогорку жана төмөн тобокелдик топтордо ген экспрессиясын көрсөтөт.(HK) IC50 жогорку жана төмөнкү тобокелдик топторунда ракка каршы атайын препараттар үчүн баалуулуктар.*p <0,05, **p <0,01, ns = маанилүү эмес
Биз андан ары TCGA-PAAD когортундагы тобокелдик упайлары менен жалпы химиотерапия агенттеринин ортосундагы байланышты бааладык.Биз панкреатикалык ракка каршы кеңири колдонулган дарыларды издедик жана алардын IC50 баалуулуктарындагы айырмачылыктарды жогорку жана төмөнкү тобокелдик топторунун ортосундагы талдадык.Натыйжалар AZD.2281 (olaparib) IC50 мааниси жогорку тобокелдик тобунда PAAD бейтаптар AZD.2281 дарылоо (Figure 6H) туруштуу болушу мүмкүн экенин көрсөтүп, жогорку тобокелдик тобуна жогору экенин көрсөттү.Мындан тышкары, паклитакселдин, сорафенибдин жана эрлотинибдин IC50 маанилери жогорку тобокелдик тобунда төмөн болгон (сүрөт 6I-K).Андан ары биз жогорку тобокелдик тобунда IC50 жогору болгон 34 антиракка каршы дарыларды жана жогорку тобокелдик тобунда IC50 мааниси төмөн 34 ракка каршы дарыларды аныктадык (2-таблица).
lncRNAs, mRNAs жана miRNAs кеңири бар экенин жана рактын өнүгүшүндө чечүүчү ролду ойноорун танууга болбойт.Рактын бир нече түрлөрүндө жалпы жашоону болжолдоодо мРНКнын же миРНКнын маанилүү ролун колдогон көптөгөн далилдер бар.Албетте, көптөгөн прогноздук тобокелдик моделдери lncRNAларга негизделген.Мисалы, Луо жана башкалар.Изилдөөлөр көрсөткөндөй, LINC01094 PC пролиферациясында жана метастазында негизги ролду ойнойт, ал эми LINC01094 жогорку экспрессиясы уйку безинин рагы менен ооругандардын жашоосу начар экенин көрсөтүп турат [16].Лин жана башкалар тарабынан берилген изилдөө.Изилдөөлөр көрсөткөндөй, lncRNA FLVCR1-AS1 төмөндөшү уйку безинин рагы менен ооруган бейтаптарда начар прогноз менен байланышкан [17].Бирок, иммунитет менен байланышкан lncRNAs рак менен ооруган бейтаптардын жалпы жашоону болжолдоо жагынан салыштырмалуу азыраак талкууланат.Акыркы убакта рак менен ооругандардын аман калышын болжолдоо жана ошону менен дарылоо ыкмаларын тууралоо үчүн прогностикалык тобокелдик моделдерин түзүүгө багытталган көп иштер [18, 19, 20].Рак оорусунун башталышында, прогрессинде жана химиотерапия сыяктуу дарылоого жооп кайтарууда иммундук инфильтраттардын маанилүү ролу өсүп баратат.Көптөгөн изилдөөлөр шишик-инфильтрациялоочу иммундук клеткалар цитотоксикалык химиотерапияга жооп берүүдө маанилүү ролду ойноорун тастыктады [21, 22, 23].Шишиктин иммундук микрочөйрөсү шишик менен ооругандардын жашоосунун маанилүү фактору болуп саналат [24, 25].Иммунотерапия, өзгөчө ICI терапиясы катуу шишиктерди дарылоодо кеңири колдонулат [26].Иммундук менен байланышкан гендер прогностикалык тобокелдик моделдерин куруу үчүн кеңири колдонулат.Мисалы, Су жана башкалар.Иммундук менен байланышкан прогностикалык тобокелдик модели энелик бездин рагы менен ооруган бейтаптардын прогнозун алдын ала айтуу үчүн белок коддоочу гендерге негизделген [27].lncRNAs сыяктуу коддолбогон гендер да прогноздук тобокелдик моделдерин түзүүгө ылайыктуу [28, 29, 30].Луо жана башкалар төрт иммундук lncRNA сынап, жатын моюнчасынын рагы коркунучу үчүн алдын ала моделин курган [31].Хан жана башкалар.Бардыгы болуп 32 дифференциалдуу экспрессияланган стенограммалар аныкталган жана анын негизинде 5 маанилүү стенограммасы бар болжолдоо модели түзүлгөн, ал бөйрөк трансплантациясынан кийин биопсия менен далилденген курч баш тартууну болжолдоо үчүн абдан сунушталган инструмент катары сунушталган [32].
Бул моделдердин көбү гендин экспрессия деңгээлине негизделген, же протеинди коддоочу гендер же коддобогон гендер.Бирок, бир эле ген ар кандай геномдордо, маалымат форматтарында жана ар кандай пациенттерде ар кандай экспрессия маанилерине ээ болушу мүмкүн, бул болжолдуу моделдерде туруксуз бааларга алып келет.Бул изилдөөдө биз так туюнтма маанилеринен көз карандысыз эки жуп lncRNA менен акылга сыярлык моделди курдук.
Бул изилдөөдө биз биринчи жолу irlncRNAны иммунитетке байланыштуу гендер менен корреляциялык анализ аркылуу аныктадык.Биз 223 DEirlncRNAны дифференциалдуу экспрессияланган lncRNAs менен гибриддештирүү жолу менен текшердик.Экинчиден, биз жарыяланган DEirlncRNA жупташтыруу ыкмасынын негизинде 0-же-1 матрицасын түздүк [31].Андан кийин биз прогноздук DEirlncRNA жуптарын аныктоо жана болжолдуу тобокелдик моделин куруу үчүн универсалдуу жана лассо регрессиялык анализдерди жүргүздүк.Биз андан ары PAAD менен ооруган бейтаптардагы тобокелдик баллдары менен клиникалык мүнөздөмөлөрдүн ортосундагы байланышты талдап чыктык.Биз PAAD бейтаптарындагы көз карандысыз прогностикалык фактор катары биздин прогностикалык тобокелдик моделибиз жогорку класстагы бейтаптарды төмөнкү класстагы бейтаптардан жана жогорку класстагы бейтаптарды төмөнкү класстагы бейтаптардан натыйжалуу айырмалай аларын таптык.Мындан тышкары, прогностикалык тобокелдик моделинин ROC ийри сызыгынын AUC маанилери 1 жылдык божомол үчүн 0,905, 2 жылдык болжолдоо үчүн 0,942 жана 3 жылдык болжолдоо үчүн 0,966 болгон.
Окумуштуулар CD8+ Т-клетка инфильтрациясынын жогору болгон бейтаптар ICI дарылоого көбүрөөк сезгич болушкан деп билдирди [33].Шишиктин иммундук микрочөйрөсүндө цитотоксикалык клеткалардын, CD56 NK клеткаларынын, NK клеткаларынын жана CD8+ Т-клеткаларынын мазмунунун көбөйүшү шишиктин басуучу эффектинин себептеринин бири болушу мүмкүн [34].Мурунку изилдөөлөр шишик-инфильтрациялоочу CD4 (+) T жана CD8 (+) T жогорку деңгээли узак жашоо менен олуттуу байланышта экенин көрсөттү [35].CD8 Т-клеткасынын начар инфильтрациясы, неоантигендин аз жүгү жана жогорку иммуносупрессивдүү шишик микрочөйрөсү ICI терапиясына жооптун жоктугуна алып келет [36].Биз тобокелдик упайынын CD8+ Т-клеткалары жана NK клеткалары менен терс корреляцияланганын байкадык, бул жогорку тобокелдик упайлары бар бейтаптар ICI дарылоо үчүн ылайыктуу эмес жана начар прогнозга ээ болушу мүмкүн экенин көрсөтүп турат.
CD161 табигый өлтүргүч (NK) клеткалардын маркери болуп саналат.CD8+CD161+ CAR-трансдукцияланган Т-клеткалар HER2+ панкреатикалык каналдын аденокарциномасынын ксеногрант моделдеринде in vivo шишикке каршы эффективдүүлүгүн жогорулатат [37].Иммундук текшерүү пунктунун ингибиторлору цитотоксиктүү Т-лимфоцит менен байланышкан протеин 4 (CTLA-4) жана программаланган клетка өлүмүнүн белок 1 (PD-1)/программаланган клетка өлүмүнүн лиганд 1 (PD-L1) жолдоруна багытталган жана көптөгөн аймактарда чоң потенциалга ээ.CTLA-4 жана CD161 (KLRB1) экспрессиясы жогорку тобокелдик топторунда төмөн болуп саналат, андан ары жогорку тобокелдик упайлары менен бейтаптар ICI дарылоо үчүн жарамдуу болушу мүмкүн эмес экенин көрсөтүп турат.[38]
Жогорку тобокелдиктеги бейтаптар үчүн ылайыктуу дарылоо жолдорун табуу үчүн биз ар кандай ракка каршы дары-дармектерди талдап көрдүк жана PAAD менен ооруган бейтаптарда кеңири колдонулган паклитаксел, сорафениб жана эрлотиниб PAAD менен ооруган бейтаптар үчүн ылайыктуу болушу мүмкүн экенин таптык.[33].Чжан жана башкалар ДНКнын бузулушуна жооп (DDR) жолундагы мутациялар простата безинин рагы менен ооруган бейтаптарда начар прогнозго алып келиши мүмкүн экенин аныкташкан [39].Уйку безинин рагы Olaparib Congoing (POLO) сыноосу уйку безинин каналдык аденокарциномасы жана урук линиясынын BRCA1/2 мутациялары бар бейтаптарда платина негизиндеги химиотерапиядан кийин плацебо менен салыштырганда олапариб менен сактоочу дарылоо узакка созулганын көрсөттү [40].Бул бейтаптардын бул чакан тобунда дарылоонун натыйжалары кыйла жакшырат деген олуттуу оптимизмди камсыз кылат.Бул изилдөөдө, AZD.2281 (olaparib) IC50 мааниси жогорку тобокелдик тобунда PAAD бейтаптар AZD.2281 менен дарылоого туруктуу болушу мүмкүн экенин көрсөтүп, жогору болгон.
Бул изилдөөдө болжолдоо моделдери жакшы прогноздук натыйжаларды берет, бирок алар аналитикалык болжолдорго негизделген.Бул натыйжаларды клиникалык маалыматтар менен кантип ырастоо маанилүү суроо.Эндоскопиялык майда ийне аспирациялык УЗИ (EUS-FNA) 85% сезгичтиги жана 98% өзгөчөлүгү менен панкреатикалык катуу жана экстрапанкреатикалык жабыркоолорду диагностикалоонун ажырагыс ыкмасы болуп калды [41].EUS ичке ийне биопсиясы (EUS-FNB) ийнелеринин пайда болушу, негизинен, диагностикалык тактыктын жогору болушу, гистологиялык структураны сактаган үлгүлөрдү алуу жана ошону менен белгилүү бир диагноздор үчүн маанилүү болгон иммундук кыртыштарды түзүү сыяктуу FNAга караганда кабыл алынган артыкчылыктарга негизделген.атайын боёо [42].Адабияттарды системалуу карап чыгуу FNB ийнелери (айрыкча 22G) уйку безинин массаларынан кыртыштарды жыйноодо эң жогорку эффективдүүлүктү көрсөтөөрүн тастыктады [43].Клиникалык жактан аз гана бейтаптар радикалдуу операция жасоого жарамдуу жана алгачкы диагноз коюлган учурда бейтаптардын көпчүлүгүндө иштебей турган шишик бар.Клиникалык практикада оорулуулардын бир аз гана бөлүгү радикалдуу хирургияга ылайыктуу, анткени алгачкы диагноз коюу учурунда бейтаптардын көпчүлүгүндө иштебей турган шишик бар.EUS-FNB жана башка ыкмалар менен патологиялык тастыкталгандан кийин, стандартташтырылган хирургиялык эмес дарылоо, мисалы, химиотерапия, адатта, тандалат.Биздин кийинки изилдөө программабыз бул изилдөөнүн прогностикалык моделин ретроспективдүү талдоо аркылуу хирургиялык жана хирургиялык эмес когорттарда сынап көрүү болуп саналат.
Жалпысынан алганда, биздин изилдөө уйку безинин рагы менен ооруган бейтаптарда келечектүү прогностикалык маанини көрсөткөн жупташкан irlncRNAга негизделген жаңы прогностикалык тобокелдик моделин түздү.Биздин прогноздук тобокелдик модели медициналык дарылоо үчүн ылайыктуу PAAD менен ооругандарды айырмалоого жардам берет.
Учурдагы изилдөөдө колдонулган жана талданган маалымат топтомдору негиздүү өтүнүч боюнча тиешелүү автордон жеткиликтүү.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. COVID-19 пандемиясынын учурунда терс эмоцияларды эмоционалдык жөнгө салууда өзүн-өзү натыйжалуулуктун ортомчу ролу: кайчылаш изилдөө.Int J Ment Health Nurs [журналдагы макала].2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Суй Вэн, Гонг Х, Цяо Х, Чжан Л, Чэн Дж, Донг Дж, ж.б.Үй-бүлө мүчөлөрүнүн реанимация бөлүмдөрүндө альтернативалуу чечим кабыл алуу боюнча көз караштары: системалуу карап чыгуу.INT J NURS STUD [журналдагы макала;карап чыгуу].2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Герман J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Уйку безинин рагы.Лансет.[Журнал макаласы;изилдөө колдоо, NIH, сырттан окуу;изилдөө колдоо, АКШ тышкары өкмөт;карап чыгуу].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Уйку безинин рак оорусунун эпидемиологиясы.Дүйнөлүк Гастроэнтерология журналы.[Журналдагы макала, рецензия].2016 28.11.2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. уйку безинин рагы менен ооруган бейтаптардын жалпы жашоону болжолдоо үчүн жаңы tp53 менен байланышкан номограмма.BMC Рак [журнал макаласы].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. химиотерапия алган колоректалдык рагы менен ооруган рак менен байланышкан чарчоо боюнча чечимге багытталган терапиянын таасири: рандомизацияланган көзөмөлдөгү сыноо.Рак медайымы.[Журнал макаласы;рандомизацияланган контролдонуучу сыноо;изилдөө Кошмо Штаттардан тышкары өкмөт тарабынан колдоого алынат].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Чжан Чэн, Чжэн Вэн, Лу Ы, Шан Л, Сю Донг, Пан Ы, ж.б.Операциядан кийинки карциноэмбриондук антигендин (CEA) деңгээли операцияга чейинки нормалдуу CEA деңгээли бар пациенттерде колоректалдык рагы резекциясынан кийинки натыйжаны болжолдойт.Трансляциялык рак изилдөө борбору.[Журнал макаласы].2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Хун Вэн, Лян Ли, Гу Ю, Ци Цзы, Циу Хуа, Ян Х, ж.б.Иммундук менен байланышкан lncRNAs жаңы кол тамгаларды жаратат жана адамдын гепатоцеллярдык рактын иммундук ландшафтын болжолдойт.Mol Ther Nuclein acids [Журналдагы макала].2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD уйку безинин рагы үчүн иммунотерапия: тоскоолдуктар жана ачылыштар.Анн ичеги-карын хирургу [Журналдагы макала;карап чыгуу].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Узак эмес коддоочу РНКлар (LncRNAs), вирустук шишик геномикасы жана аберранттык сплайсинг окуялары: терапиялык таасирлери.AM J CANCER RES [журналдагы макала;карап чыгуу].2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Идентификация lncRNA кол эндометрия рак прогноз менен байланышкан.Илимдин жетишкендиктери [журнал макаласы].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Цзян С, Рен Н, Лю С, Лу Ц, Сю А, Цин С, ж.б.РНК-милдеттүү протеин прогностикалык гендердин жана папиллярдык клетка бөйрөк клеткасынын карциномасында дары талапкерлеринин комплекстүү анализи.преген.[Журнал макаласы].2021 20.01.2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, ж.б.Аутофагияга байланыштуу узак коддолбогон РНКнын мүнөздөмөлөрү эмчек рагы прогнозун болжолдойт.преген.[Журнал макаласы].2021 20.01.2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Иммундук-байланыштуу алты lncRNA кол glioblastoma multiforme менен прогнозду жакшыртат.MOL нейробиология.[Журнал макаласы].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Ву Б, Ван К, Фэй Дж, Бао Ы, Ван Х, Сонг З, ж.б.Жаңы tri-lncRNA колтамгасы уйку безинин рагы менен ооругандардын аман калышын болжолдойт.ОҢКОЛДУН ӨКҮЛДӨРҮ.[Журнал макаласы].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 LIN28B экспрессиясын жана губкалуу miR-577 аркылуу PI3K/AKT жолун жөнгө салуу менен уйку безинин рак оорусунун өнүгүшүнө өбөлгө түзөт.Mol Therapeutics – Нуклеиндик кислоталар.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, ж.б.lncRNA FLVCR1-AS1 жана KLF10 ортосундагы оң пикир PTEN/AKT жолу аркылуу уйку безинин рагынын өнүгүшүнө тоскоол болушу мүмкүн.J EXP Clin Рак Рес.2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Hepatocellular карциномада жалпы жашоону болжолдоочу он үч генди аныктоо.Biosci Rep [журнал макаласы].2021 04.09.2021.


Посттун убактысы: 22-сентябрдан 2023-жылга чейин